L’esame microscopico e colturale del secreto uretrale viene praticato per accertare la presenza di una infezione uretrale (uretrite).
Per lo più, ma non sempre, le uretriti sono delle malattie sessualmente trasmesse.
I microrganismi in causa possono essere protozoi come il Trichomonas vaginalis, o particolari microrganismi come la Chlamydia trachomatis, i Mycoplasmi urogenitali, più spesso sono i gonococchi (Neisseria gonorrhoeae). Sono agenti meno frequenti gli streptococchi beta emolitici di gruppo B ed i dissenterici.
È importante individuare l’agente morboso, dato che i diversi microrganismi sono sensibili a terapie completamente diverse.